除上述主要離子外，天然地下水還含有微量元素（包括鐵、錳、砷、氟、碘等）。一般條件下，這些微量成分由于含量低，不會對人體健康造成負面影響。少數(shù)情況下，天然地下水也會含有濃度相對較高的微量元素，高含量鐵、錳、氟及砷對地下水水質(zhì)具有一定的影響。例如，我國華北、西北、東北和黃淮海平原地區(qū)，高氟水主要存在于干旱和半干旱地區(qū)的淺層或深層地下水中，當?shù)貙又杏懈叻V物（如螢石）或高氟基巖時，地下水的含氟量就比較高。再比如，我國自20世紀80年代初在新疆發(fā)現(xiàn)地砷病以來，又先后在內(nèi)蒙古、山西、吉林等12個省（區(qū)）發(fā)現(xiàn)地砷病病區(qū)（長期飲用高砷含量地下水的居民就容易罹患飲水型地方性砷中毒，簡稱地砷病）。這些地區(qū)地下水中砷超標并不是工業(yè)化過程中污染導致的，大部分主要是地下含水層巖石向地下水水井滲析出自然環(huán)境中的無機砷造成的。對于這些問題，我們目前已有較為成熟的技術(shù)處理，只要采取適當措施，不會對飲用水水質(zhì)無隱患造成威脅。